中小机构和大型非机构可根据人行政策通过入网机构不同程度地参与银行间债券市场业务；非机构和社会个人可在银行柜台从事债券交易。
公司债是不是只能在交易所市场进行交易？交易所场内交易，参与者比较广泛，适合不同投资者，只要通过交易所开户都能参与交易（例如保险公司、基金公司、央企财务公司、企业、个人投资者），而银行间债券市场交易，顾名思义主要是一些银行类的机构进行交易的地方(不过现在已经放开了一些准机构进入，但个人投资者是不能进入交易的，而一般企业只能通过代理机构参与），一般在这个市场交易的单项金额比较大，所以交易方式也有不同，而在交易所交易是通过交易系统撮合，自动完成债券交割和清算，交易双方都不清楚对方是谁，跟买卖股票一样。而银行间债券市场交易是通过双方询价交易，双方自主完成债券结算和资金清算，就是两个银行间彼此讨价还价面对面交易；
起初，银行间债券市场交易债券交易系统提供公开报价和对话报价两种报价形式，交易双方通过交易系统界面进行格式化询价，达成一致后确认成交，然后根据双方约定的清算路径，自行清算，引入了电子化的报价驱动交易。而且政策性银行，例如农业发展银行、进出口银行、国家开发银行等发行的债，一般只能通过银行间债券市场交易。而交易所一般交易的是普通企业债券品种。